Аннотация:
Цель исследования: изучить микробиоту пищевода и желудка у больных гастроэзофагеальной рефлюксной болезнью (ГЭРБ) и здоровых добровольцев.Материалы и методы. В исследование были включены 15 пациентов, страдающих ГЭРБ, и 6 здоровых добровольцев. Всем исследуемым был проведен забор пищеводного и желудочного содержимого. Исследование микробиоты в полученных образцах было выполнено с помощью секвенирования гена 16S рибосомальной РНК (рРНК).Результаты. Наиболее распространенными типами бактерий в пищеводе и желудке у больных ГЭРБ и здоровых добровольцев были Bacteroidetes, Firmicutes, Actinobacteria, Proteobacteria, Fusobacterium. При сравнении относительного содержания основных типов бактерий в пищеводной слизи и желудочном содержимом у пациентов с ГЭРБ отмечено достоверное снижение пропорции Proteobacteria по сравнению со здоровыми добровольцами. В пищеводе у больных ГЭРБ по сравнению со здоровыми добровольцами наблюдалось снижение относительного количества бактерий, относящихся к семействам Acetobacteraceae, Bacillaceae, Bdellovibrionaceae, Clostridiales Insertae Sedis XI, Fusobacteriaceae, Moraxellaceae, Pasteurellaceae и Rhodocyclaceae. В желудке у больных ГЭРБ выявлено более высокое содержание бактерии семейств Leptotrichiaceae и Veillonellaceae.Выводы. Полученные результаты свидетельствуют о различиях внутрипросветной микробиоты пищевода и желудка у больных ГЭРБ и здоровых добровольцев. Необходимо дальнейшее изучение влияния тех или иных изменений бактериального состава на изменения в пищеводе и желудке.
This paper is aimed at investigating the microbiota of the esophagus and stomach in patients with gastroesophageal reflux disease (GERD) and healthy volunteers.Materials and methods. The study included 15 patients suffering from GERD and 6 healthy volunteers. All subjects underwent sampling of esophageal and gastric contents. The study of the microbiota in the obtained samples was performed by sequencing the 16S gene of ribosomal RNA (rRNA).Results. The most common types of bacteria in the esophagus and stomach in patients with GERD and healthy volunteers are found to be Bacteroidetes, Firmicutes, Actinobacteria, Proteobacteria, Fusobacterium. By comparing the relative contents of the main types of bacteria in the esophageal mucus and gastric contents, a significant decrease in the proportion of Proteobacteria was observed in patients with GERD as compared to healthy volunteers. The decrease in the relative number of bacteria belonging to the Acetobacteraceae, Bacillaceae, Bdellovibrionaceae, Clostridiales Insertae Sedis XI, Fusobacteriaceae, Moraxellaceae, Pasteurellaceae and Rhodocyclaceae families was observed in the esophagus in patients with GERD as compared to healthy volunteers. A higher bacterial content of the Leptotrichiaceae and Veillonellaceae families was detected in the stomach of patients with GERD.Conclusions. The obtained results indicate differences in the intraluminal microbiota of the esophagus and stomach in patients with GERD and healthy volunteers. Further study should be carried out to study the effect of changes in bacterial composition on those in the esophagus and stomach.
Румянцева Д.Е. «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» (Сеченовский Университет) Министерства здравоохранения Российской Федерации.
Трухманов А.С. «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» (Сеченовский Университет) Министерства здравоохранения Российской Федерации.
Кудрявцева А.В. «Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта» Российской академии наук; «Национальный медицинский исследовательский центр радиологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Краснов Г.С. «Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта» Российской академии наук
Параскевова А.В. «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» (Сеченовский Университет) Министерства здравоохранения Российской Федерации.
Сторонова О.А. «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» (Сеченовский Университет) Министерства здравоохранения Российской Федерации.
Пономарев А.Б. «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» (Сеченовский Университет) Министерства здравоохранения Российской Федерации.
«Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова» (Сеченовский Университет) Министерства здравоохранения Российской Федерации.
«Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта» Российской академии наук
V.A. Engelgardt Institute of Molecular Biology of the Russian Academy of Sciences
«Национальный медицинский исследовательский центр радиологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Rumyantseva D.E.
Trukhmanov A.S.
Kudryavtseva A.V. V.A. Engelgardt Institute of Molecular Biology of the Russian Academy of Sciences
Krasnov G.S. V.A. Engelgardt Institute of Molecular Biology of the Russian Academy of Sciences
Paraskevova A.V.
Storonova O.A.
Ponomarev A.B.
Microbiota of the Esophagus and Stomach in Patients with Gastroesophageal Reflux Disease and Healthy Volunteers eng
Микробиота пищевода и желудка у больных гастроэзофагеальной рефлюксной болезнью и здоровых добровольцев
Текст визуальный электронный
Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии
Т. 28, № 4 С. 36-46
2018
микробиота пищевода
esophageal microbiota
микробиота желудка
gastric microbiota
гастроэзофагеальная рефлюксная болезнь
gastroesophageal reflux disease
Статья
ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
Цель исследования: изучить микробиоту пищевода и желудка у больных гастроэзофагеальной рефлюксной болезнью (ГЭРБ) и здоровых добровольцев.Материалы и методы. В исследование были включены 15 пациентов, страдающих ГЭРБ, и 6 здоровых добровольцев. Всем исследуемым был проведен забор пищеводного и желудочного содержимого. Исследование микробиоты в полученных образцах было выполнено с помощью секвенирования гена 16S рибосомальной РНК (рРНК).Результаты. Наиболее распространенными типами бактерий в пищеводе и желудке у больных ГЭРБ и здоровых добровольцев были Bacteroidetes, Firmicutes, Actinobacteria, Proteobacteria, Fusobacterium. При сравнении относительного содержания основных типов бактерий в пищеводной слизи и желудочном содержимом у пациентов с ГЭРБ отмечено достоверное снижение пропорции Proteobacteria по сравнению со здоровыми добровольцами. В пищеводе у больных ГЭРБ по сравнению со здоровыми добровольцами наблюдалось снижение относительного количества бактерий, относящихся к семействам Acetobacteraceae, Bacillaceae, Bdellovibrionaceae, Clostridiales Insertae Sedis XI, Fusobacteriaceae, Moraxellaceae, Pasteurellaceae и Rhodocyclaceae. В желудке у больных ГЭРБ выявлено более высокое содержание бактерии семейств Leptotrichiaceae и Veillonellaceae.Выводы. Полученные результаты свидетельствуют о различиях внутрипросветной микробиоты пищевода и желудка у больных ГЭРБ и здоровых добровольцев. Необходимо дальнейшее изучение влияния тех или иных изменений бактериального состава на изменения в пищеводе и желудке.
This paper is aimed at investigating the microbiota of the esophagus and stomach in patients with gastroesophageal reflux disease (GERD) and healthy volunteers.Materials and methods. The study included 15 patients suffering from GERD and 6 healthy volunteers. All subjects underwent sampling of esophageal and gastric contents. The study of the microbiota in the obtained samples was performed by sequencing the 16S gene of ribosomal RNA (rRNA).Results. The most common types of bacteria in the esophagus and stomach in patients with GERD and healthy volunteers are found to be Bacteroidetes, Firmicutes, Actinobacteria, Proteobacteria, Fusobacterium. By comparing the relative contents of the main types of bacteria in the esophageal mucus and gastric contents, a significant decrease in the proportion of Proteobacteria was observed in patients with GERD as compared to healthy volunteers. The decrease in the relative number of bacteria belonging to the Acetobacteraceae, Bacillaceae, Bdellovibrionaceae, Clostridiales Insertae Sedis XI, Fusobacteriaceae, Moraxellaceae, Pasteurellaceae and Rhodocyclaceae families was observed in the esophagus in patients with GERD as compared to healthy volunteers. A higher bacterial content of the Leptotrichiaceae and Veillonellaceae families was detected in the stomach of patients with GERD.Conclusions. The obtained results indicate differences in the intraluminal microbiota of the esophagus and stomach in patients with GERD and healthy volunteers. Further study should be carried out to study the effect of changes in bacterial composition on those in the esophagus and stomach.